Enamjaolt jaotatakse nad suurtemateks gruppideks: 1. “Tõelised alkaloidid” , mis sisaldavad lämmastikku heterotsüklis ja tulenevad amino hapetest. (Atropiin, nikotiin, morfiin, jne.) 2. “Protoalkaloidid” , mis sisaldavad lämmastikku ja tulenevad ka amino hapetest. (Meskaliin, adrenaliin, epinefriin, jne.) 3. Püloamiinsed alkaloidid. 4. Peptiidsed ja tsüklopeptiidsed alkaloidid. 5. Pseudoalkaloidid - Alkaloidi laadsed ühendid mis ei tulene aminohapetest. Selles grupis on terpeeni ja steroidide laadseid alkaloide, lisaks ka puriini-laadseid nagu kohveiin, teobromiin, jne. Omadused Enamjaolt on tegemist nõrkade alustega, kuid mõningad näiteks nagu teobromiin on amfoteersed. Paljud alkaloidid lahustuvad vees halvasti, aga orgaanilistes lahustes (dietüül eeter, cloroform, jne) hästi