Molekulaar- ja rakubioloogia
4. Re-suspendeeri pellet (väike hunnik rakke epsi põhjas) 0,2 ml-s E1 lahuses
Ole hoolas: lahusesse jäävad klämbud ei lüüsu järgmises etapis täielikult ja
seega saad vähem plasmiidi. Glükoos muudab E1 lahuse isotooniliseks, EDTA
seob kahevalentsed katioone (seega inhibeerib paljusid ensüüme, kes
töötamiseks neid enda koostisse vajavad) ja Tris on puhverdav reagent. RNAas
A eemaldab bakteraalse RNA prepsist(ehk prepareeritavast plasmiidsest
DNAst)
5. Lisa 0,2ml E2 lahust ning pipeteeri mitu korda edasi-tagasi.
E2-s sisalduv SDS solubiliseerib (lahustab pisikesteks puhvris ujuvateks
mullikesteks e.mitsellideks) bakteriraku membraani fosfolipiidid ning
denatureerib valgud. Naatriumhüdroksiid aga denatureerib DNA struktuurid.
Lahus muutub"tatiseks"
6. Inkubeeri laua peal 3 minutit. Selle aja jooksul muutub lahus selgemaks.