BIOinformaatika kodutöö 5
c. Koodonite kasutussageduse uurimine, mustrite otsimine järjestuses, nukleotiidide ja
aminohapete sisaldused järjestustes, ORF-de leidmine, PCR produktide otsimine, valgu
isoelektrilise punkti arvutamine, valgu molekulmassi arvutamine, restriktsioonisaitide
kindlakstegemine, (de)transleerimine, restriktsioonikaartide tegemine, translatsioonikaardid,
praimerikaardid.
Aldolaasi E. coli nukleotiidne järjestus:
>eco:b2097 fbaB, dhnA; fructose-bisphosphate aldolase class I [EC:4.1.2.13]; K01623 fructose-bisphosphate
aldolase, class I
atgacagatattgcgcagttgcttggcaaagacgccgacaaccttttacagcaccgttgt
atgacaattccttctgaccagctttatctccccggacatgactacgtagaccgcgtaatg
attgacaataatcgcccgccagcggtgttacgtaatatgcagacgttgtacaacaccggg
cgtctggctggcacaggatatctttctattctgccggttgaccagggcgttgagcactct
gccggagcttcatttgctgctaacccgctctactttgacccgaaaaacattgttgaactg