Pakkimise põhimõtted: · Peptiidahel peab pakkimisel arvestama piirangutega, mis tulenevad tema struktuurist · Peptiidahel pakitakse nii, et hüdrofoobsed jäägid peidetakse gloobuli sisemusse, millega väheneb nende kontakt veega. · Peptiidahelal, mis koosneb L aminohapetest, on kalduvus ,,parema käe pöördele" · Alfa-heeliksid ja beeta-lehed pakitakse sageli kihtidena, kus hüdrofoobsed jäägid on peidetud kihtide vahele · Kihtide välisküljed on kaetud kõige polaarsemate jääkidega, mis eelistatult interakteeruvad veega. Pakkimise etapid: 1. Kiire ja pöörduv lokaalsete sekundaarsete struktuuride moodustumine 2. Domeenide moodustumine kooperatiivse agregatsiooni teel pakkimistsentrite ümber 3. Esmase gloobuli teke ühendatud domeenidest 4. Domeenide konformatsiooni täpsustamine 5. Lõplik valgu monomeer. · Kiudvalgud ehk fibrillaarsed valgud: Ehitus: Koosnevad peamiselt heeliksitest
BIOKEEMIA test I Valkude pakkimine kihtidena Pakitakse nii, et hüdrofoobsed jäägid peidetakse gloobuli sisemusse, millega väheneb nende kontakt veega. Peptiidahelal, mis koosneb L- aminohapetest, on kalduvus ,,parema käe pööretele" -heeliksid ja -lehed pakitakse sageli kihtidena, kus hüdrofoobsed jäägid on peidetud kihtide vahele. Kihtide välisküljed on kaetud kõige polaarsemate jääkidega, mis eelistatult interakteeruvad veega. Globulaarsete valkude klassifikatsioon antiparalleelse -helikaalse struktuuriga valgud lihtsaim heeliksite pakkimisviis lühikesed ühendavad silmused ja antiparalleelne pakkimine, heeliksite kimp on sageli kergelt vasakule pööratud. Hapnikku transportivad globuliinid (hemoglobiin, müoglobiin) on antiparalleelsed -valgud