Mikroobifusioloogia
valgud.
14.5. Biofilmi kesksed signaalrajad
C-di-GMP signaalirada. Tsütoplasmaatiline c-di-GMP (bis-(3'-5')-
tsükliline dimeerne GMP) on bakteritel laialt levinud ning peamine alarmoon,
mille abil lülitatakse bakteri füsioloogia ümber planktiliselt eluviisilt paiksele
(biofilm) või vastupidi. Üldiselt, kõrge c-di-GMP kontsentratsioon rakus soodustab
biofilmi moodustumist, madal kontsentratsioon, aga biofilmist irdumist ja
planktilist eluvormi. Bakteris reguleeritakse c-di-GMP kontsentratsiooni kahe
vastandlike reaktsioonidega ensüümide aktiivsuse ja hulgaga: diguanolüül
tsüklaasid (DGC), konserveerunud GGDEF motiiv, toodavad alarmooni ning
fosfodiesteraasid (PDE), konserveerunud EAL motiiv, lagundavad alarmooni.
Gamma-proteobakterid torkavad eriti silma oma ortoloogide rohkusega, mis on
seotud c-di-GMP metabolismis. Eriti palju on neis bakterites valke, millel on