"pirnade" - 1 õppematerjal

Genoomi struktuur ja funktsioon

On väga levinud taimedes kus kaitsevad taime erinevate patogeenide eest. Tekivad pikkadest kaheahelalistest RNA lõikudest.  piRNA – suuremad kui miRNAd ja siRNAd. Seonduvad PIWI perekonna valkudega, millede välja lülitamisel väljendub kordusjärjestuste kontrollimatu transkriptsioon. Esineb kahte tüüpi piRNAsid: varasemad pärinevad kordusjärjestustelt, hilisemad suurtest genoomsetest piRNA klastritest. Dicer ei osale piRNAde sünteesis. PIWI tüüpi valgud lõikavad märklaud-RNAd. piRNAd on vajalikud, et kaitsta genoomi mobiilsete elementide ja korduselementide plahvatusliku paljunemise eest. • • AGO valgud ja RISC kompleks • Argonaut valgud jaotatakse kolme rühma: 1. Argonaut sarnased valgud, mis sarnanevad arabidopsis thaliana AGO1 valguga 2. Piwi sarnased valgud, mis sarnanevad D.melanogaster PIWI valguga 3. C