Molekulaarne evolutsioon
mille korral puu kogupikkus on kõige väiksem. Samamoodi leitakse
järgmised naabrid kuni puu on lahendatud ja kõik harude pikkused
teada.
32. Kuidas hindab puu harude pikkusi kaalumata paaride
meetod aritmeetilise keskmisega (UPGMA) ja kuidas Fitch-
Margoliash´i meetod?
UPGMA meetodi puhul haru pikkus = järjestuste geneetilise kauguse
aritmeetiline keskmine. Kui evolutsiooni kiirus on konstantne,
saadakse õiged pikkushinnangud, kui aga ei ole, saadakse valed.
FT meetodi korral on kolme järjestuse puul harude pikkused üheselt
määratud. Rohkem kui kolme järjestuse korral leitakse servade
pikkused ühendtaksonite vahendusel.
33. Iseloomustage vähimruutude (least squares) meetodit.
Vähimruutude meetod mõõdab distantsmaatriksis toodud ja
patristiliste kauguste erinevust. Valib puu, mille korral on nende
kauguste erinevus kõige väiksem. Ehk eelistab sellist puud, mille