Molekulaarne evolutsioon
aritmeetiline keskmine. Kui evolutsiooni kiirus on konstantne,
saadakse õiged pikkushinnangud, kui aga ei ole, saadakse valed.
FT meetodi korral on kolme järjestuse puul harude pikkused üheselt
määratud. Rohkem kui kolme järjestuse korral leitakse servade
pikkused ühendtaksonite vahendusel.
33. Iseloomustage vähimruutude (least squares) meetodit.
Vähimruutude meetod mõõdab distantsmaatriksis toodud ja
patristiliste kauguste erinevust. Valib puu, mille korral on nende
kauguste erinevus kõige väiksem. Ehk eelistab sellist puud, mille
paariviisiliste ja puu kauguste vahede ruutude summa on vähim.
Vähimruutude meetod võimaldab leida harude pikkused mistahes
topoloogiale.
34. Iseloomustage säästumeetodit (maximum parsimony).
Puu konstrueeritakse kasutades vähimat võimalikku asenduste
hulka. Kasutab DNA järjestusi otse. Tehakse mitu võimalikku puud
annaabi.ee 
