Küüditamine
Jätkusid 1941. a. Suvel alanud kohtuvälised repressioonid. SD eriüksused hävitasid kõigepealt tuhatkond Eestisse jäänud juuti. Eestlastest hukkus repressioonide käigus
4000- 5000 inimest. Eesti territooriumile rajati koonduslaagreid, kus hävitati Euroopast Eestisse toodud juute.
Kõigele vatamata jäi Saksa okupatsioon Nõukogude okupatsiooniga võrreldes suhteliselt pehmeks. See lõikas juba ette pinna alt nõukogude võimu poolt põhjalikult
ettevalmistatud partisaniliikumisel.
Nõukogude võimuorganite taastamine Eestis algas 1944. aastal koos maa vallutamisega. Nõukogude vägede tagasitulek ei sarnanenud raasugi nende korrapärase
sissemarsiga 1940. aastal. Vahetevahel eelnes sellele äge sõjategevus, sest sakslased püüdisd mitmel korral oma rinnet tugevdada. Punaarmee tagasiilmumise
kuupäevaks võib lugeda 20. jaanuari 1944 , kui jõuti Narva alla. Aasta lõpuks väljakujunenud Eesti NSV võimustruktuur püsis väiksemate muudatustega