"parsimonious" - 1 õppematerjal

Bioinformaatika arvestus ül

edu/phylip.html, tutvuda programmide dokumentatsiooniga, kasutusjuhend http://koti.mbnet.fi/tuimala/oppaat/phylip2.pdf) ­ salvestatud MSA fail peab olema PHYLIP formaadis: 1. MP metoodi kasutamisel arvutada fülogeneetilised puud kasutades järgmisi programme: Vastus: a. DNAPARS DNA parsimony algorithm, version 3.66 One most parsimonious tree found: +spt_SPA025 +--3 +--2 +stm_STM024 | | | +sfl_SF4435 | 1-ece_Z0213 | +eco_b0201 requires a total of 82.000 between and length ------- --- ------ 1 2 0.006113 2 3 0.021879 3 spt_SPA025 0.003539 3 stm_STM024 0.015122 2 sfl_SF4435 0.004826 1 ece_Z0213 0.000644 1 eco_b0201 0.000644