"paraloogia" - 1 õppematerjal

Genoomika kursuse kordamispunktid vastatud

influenza ja M.genitaliumi on minimaalse genoomi suurus 300 geeni (arvestatud ortoloogsete geenide hulka ja geeniasendusi s.t. samaseid funktsioone kannavad mitteortoloogsed geenid). Minimaalse genoomi mõiste seotud ortoloogsete geenide klastrite mõistega (COG), sisaldavad ka erinevaid paralooge. Genoomide võrdlemine toob esile 327 universaalset COG-d, defineerides ka organismile vajaliku minimaalse geenide hulga. Genoomi suurust peegeldab ka genoomi asendatavus (redundancy), mis on võrdne paraloogia tasemega. Seda omakorda defineeritakse geenide fraktsiooni järgi, millel on genoomis vähemalt üks paraloog. Paraloogia suhteline tase kahe genoomi vahel on võrdne RLP12=ruutjuur N1/N2. N1 ja N2 on geenide arv kahes erinevas genoomis. Paraloogia tase E.coli ja H.influenza jaoks on vastavalt 50% ja 33% ning RLP=1.52, kui geenide arvu vaheline suhe on 2.5. Mutatsioonimehhanismid, mis otseselt mõjutavad genoomi suuruse arengut: Kombinatoorne mutatsioonide ja