Mikroobifusioloogia
(Juncus trifidus). Kuigi taimedest on leitud valdavalt neljast hõimkonnast
baktereid, kuuluvad bakterid väga paljudesse perekondadesse ning taim-bakter
suhe, kas tegu on mutualismi või patogeensusega, sõltub rohkem taime ja
bakteri genotüübist, kui sellest, millise bakterina on ta varem kirjeldatud.
Proteobacteria hõimkonnast on enim leitud taimedest -proteobaktereid
(26%), millest omakorda on enim kirjeldatud liike perekondadest Pseudomonas,
Enterobacter, Pantoea, Stenotrophamonas ja Acinetobacter. Perekonna
Pseudomonas tuntud liikidest on kirjeldatud nii taime kasvu soodustavaid liike, P.
fluorescens, P. putida kui ka taimpatogeene nagu P. aeruginosa, P. syringae, kui
ka inimpatogeene P. aeruginosa. Sarnaselt perekonnale Pseudomonas võib leida
ka teistest bakteriperekondadest nii mutualistlikke baktereid, kommensante kui
ka patogeenseid liike.
Klassist -Proteobacteria on enim kirjeldatud perekonna Rhizobium ja