Otsmised pöördkordusjärjestused (nt IS elemendil)- mõlemas otsas on IR järjestused (inverted repeat) ehk 9 50 bp otsmised pöördkordusjärjestused (vastassuunalised, palindroomsed). Järjestused, mis on ühesugused 5' 3' suunas lugedes Otsekordusjärjestused (DR järjestused, nt IS elemendil) - IS-elemendi insertsioonil tekivad elemendi otstes 2 13 bp pikad DR- (direct repeat) ehk otsekordusjärjestused (vt. AH lk. 591, joon19.2) Palindroomne järjestus ehk vastassuunaline järjestus Transpositsiooniimmuunsus - nähtus, kus transpositsioon muutub harvemaks, kui sama TE on juba DNA -s cDNA dna molekult, missünteesitakse rna-lt ning siseneb uude kohta genoomis. 11. liigiti konserveerunud järjestused - Genoomides erinevatel liikidel sarnased piirkonnad, mis sisaldavad tavaliselt elutähtsaid geene. Nende alade vahele jäävad suhteliselt muutlikud genoomi regioonid. Muutuvas alas on iseloomulikud nn
ja lõikab DNA- molekuli selles restriktsioonisaidis või selle lähedal katki. Lihtsamalt öeldes on see bakteriaalne kaitsesüsteem kaitsmaks bakterirakke võõraste DNAde eest, tunnevad ära võõra DNA ja lõikavad selle ahela katki. Kloonimise seisukohalt on head tüüp II restrikaasid, mis tunnevad ära kindla nukleotiidijärjestusega restrikaaside äratundmissaidid ning põhjustavad nendes kohtades DNA- molekuli katkilõikamist, äratundmissaidis on palindroomne DNA- järjestus. Võib saada tömpide otstega DNA lõigud, kui mõlemas DNA- ahelas põhjustatakse katked samas DNA puntkis või kleepuvate otstega DNA lõigus, kui katkemised toimuvad erinevates ahelates teineteise suhtes nihkes, DNA ligaas sünteesib nende vahele fosfordiestersideme, moodustuvad rekombinantsed DNA- molekulid. 41. DNA kloneerimise etapid. Et töötada spetsiifiliste geenidega, tehakse DNA-st `geeni-suurused' koopiad
2-Elongatsioon Pärast 8-9 aluspaariga ahela sigma faktor vabastatakse ja läheb uue reaktsiooni läbiviimiseks. RNA polümeraas viib ülejäänud transkriptsiooni läbi kiirusega 30-50 bp/sekundis. DNA keerdub lahti kiiresti ja kohe pärast ensüümi mõõdumist taastub. Seepärast mingil ajal on osa RNAst hübridiseerunud DNAga, enamus aga vabaneb kohe kui heeliks taastub. 3-Terminatsioon Prokarüootidel kaks ternminaator järjestust: I tüüpi - Palindroomne, inverteeritud kordus moodustab silmuse, millega vabaneb DNA-RNA hübriid. II tüüpi - Spetsiifiline valk, mis lõhub vesiniksidemed DNA-RNA hübriidi vahel. Geenil on kolm piirkonda (alati ja kõikidel geenidel). Peale selle, eukarüootidel on ühte geeni reguleerivaid piirkondi, võib olla üle genoomi erinevaid. On olemas promootorpiirkond, piirkond valgu struktuuri määramiseks, dermineeriv piirkond (kohapeal enam transkriptsiooni ei ole või see lõpetatakse ära)
annaabi.ee 
