Populatsioonigeneetika eksam
lõputute saitide mudelit. Kasutades sedasama leitud π, paigutatakse puudele
juhuslikult mutatsioonid (π/2 igale liinile – juurest tipuni). Nüüd on võimalik
nende puude pealt tuletada DNA järjestused ja iga simulatsiooni kohta
arvutada π. Nii same π hinnangute jaotuse millelt saame hinnata näiteks 95%
usalduspiire.
3. Mida saab välja lugeda populatsiooni sisese paariviisiliste
erinevuste jaotusest.
Paasiviisiliste erinevuste jaotus kannab informatsiooni populatsiooni ajaloost.
4. Mis asi on asenduste sagedusspekter (Site Frecuency Spectrum) ja
mida võiks järeldada kui näeme populatsioonis palju rohkem
haruldasi mutatsioone kui konstantset populatsioonisuurust eeldava
koalesentsi mudeli põhjal simuleeritud andmetes?
Asenduste sagedusspekter on haplotüübi sagedusspekter. Kui näeme
populatsioonis palju rohkem haruldasi mutatsioone kui konstantset