Molekulaardiagnostika
3. STR markerite iseloomustus (korduste tüübid, alleelide tähistamine, alleelide eristamine).
· Dinukleotiid
· Trinukleotiid
· Tetranukleotiid
· Pentanukleotiid
· Heksanukleotiid
Alleele eristatakse pikkuse alusel ehk mõõdetakse DNA juppide pikkusi. Mida suurem on 2
alleeli pikkuse erinevus, seda väiksem võib lahutustundlikkus olla. Näiteks 1 nukleotiidilise
erinevuse nägemiseks peab suurem lahutusvõime olema agaroosgeelil paarinukleotiidilist
erinevust ei erista.
Kordused->kordusühikud->kordusjärjetused.
Kordused võivad ka järjetuse siseselt natuke erineda.
Korduste arv lookuses on erinev alleelid erinevad teineteisest selle poolest, mitu korda seda
kordust seal on. Sellega külgnev ala pole polümorfne ja selle vastu disainitakse praimerid. Kui
saame vanematelt täpselt samasugused alleelid samade korduste arvuga, on nad sama lookuse
suhtes homosügootsed.
Tavaanalüüsil kasutatakse erinevaid lookusi eri kromosoomides