"otupunktid" - 1 õppematerjal

Biosüstemaatika teooria ja meetodid

Ordinatsioonimeetodeid on teisigi, kuid tänapäevases fülogeneetilises süstemaatikas nad eriti kasutamist ei leia. Vajadusel saab neid hõlpsalt genereerida arvutiprogrammidega NTSYS-pc ja SYSTAT; kasutatavate algorit- mide lühikirjelduse võib leida näit. raamatus G. Dunn & B.S. Everitt, An introduction to mathematical taxonomy. Cambridge University Press, Cam- bridge et al., 1982. 7.4.2.1. Minimaalkauguste puu (minimum spanning tree) on niisugune graaf, milles OTUpunktid (juba olemasoleval, näit. peakoordinaatanalüüsiga saadud tasapinnalisel kujutisel) on omavahel joontega ühendatud vastavalt nende (algsele, mitte kujutisel mõneti moondunud) omavahelistele distantsi- dele (erinevustele). See on tüüpiline matemaatilises topoloogias tuntud rändkaupmehe ülesande lahendus: joontega seotakse OTUpunktid nii, et joonte kogupikkus oleks minimaalne. Piiravateks tingimusteks on, et 1) ei või esi-