Tallinna Püha Miikaeli klooster
köeti samuti hüpokaustahjuga. [ 5, lk 47 ; 6, lk 47, 48, 51- 54]
Osaliselt kahekorruseline ristikäik sidus kiriku kalusuuriga ning kulges kiriku kohal
läbi tugipiilarite. Ristikäigu ülemine korrus oli tõenäoliselt puidust ning lõpeb kiriku kõrval
konsoolärkliga, mille kaudu pääsesid nunnad kiriku rõdukorrusele. Kirikutiiva ristikäigu
alumine korrus ühendas läänetiiva kirikuga. [ 2, lk 229; 5, lk 47] Ida- ning põhjatiiva
sisekülgedelt pole leitud võlvitud ristikäigule osututavaid kivikonstruktsioone. [6, lk 57]
Luterliku reformatsiooniliikumise ajal 16. sajandil jätkusid missad kuni 1543. aastani.
Kloostri abtiss Elsbe Soye astus luteri usku ning valitses edasi emanda seisuses. Kloostri
sisekord muutus rangemaks ning 1598. aastal keelati nunnade lahkumine kloostrist.
5
Klooster kaotas oma kunagised privileegid ning muudeti aadlitütarlaste kasvatuskooliks,