Mikroobifusioloogia
Üldiselt, kõrge c-di-GMP kontsentratsioon rakus soodustab
biofilmi moodustumist, madal kontsentratsioon, aga biofilmist irdumist ja
planktilist eluvormi. Bakteris reguleeritakse c-di-GMP kontsentratsiooni kahe
vastandlike reaktsioonidega ensüümide aktiivsuse ja hulgaga: diguanolüül
tsüklaasid (DGC), konserveerunud GGDEF motiiv, toodavad alarmooni ning
fosfodiesteraasid (PDE), konserveerunud EAL motiiv, lagundavad alarmooni.
Gamma-proteobakterid torkavad eriti silma oma ortoloogide rohkusega, mis on
seotud c-di-GMP metabolismis. Eriti palju on neis bakterites valke, millel on
mõlemad domäänid alarmooni sünteesi ja lagundamisdomään. Tavaliselt on
nendel domäänidel erinev substraadiga seondumis ja inhibitsioonikonstant, mille
tõttu ensüüm tagab c-di-GMP kontsentratsiooni ühe domääni
inhibitsioonikonstandi lähedal. Kui arvestada, et alarmooni metabolismis
123
annaabi.ee 
