GMO
viiruste tekkele, mille mõju keskkonnale ei ole võimalik ennustada. Siirdatud muundinfo edasine
levik võib olla kontrollimatu. Tubakataimedest on antibiootikumile resistentne markergeen
ülekandunud taimes leidunud baktereisse, samuti viirustesse. Seega võib geneetiline materjal levida
edasi mitmesugustele mikroorganismidele, sealhulgas haigustekitajatele. Muundatud õietolmust
toitunud mesilasel on muundinfo siirdunud mesilase soolebaktereile. Kuidas mõjutab see mesilase
soole mikrofl oorat ning kas võõr-DNA võib siirduda sealt edasi ka mesilase keharakkudele, pole
veel selge. Muundsuhkrupeedi juurtest on transgeenne materjal liikunud edasi mullabaktereile.
Kuidas see sealt edasi liigub ja mullakoosluste elu mõjutab, selgub alles pikema aja jooksul.
Teadaolevalt on Bt toksiini sünteesiva kompleksi siirdamine taimedesse mõjutanud taimes geenide
vahelisi toimeid ja muutnud ka muid omadusi, näiteks kartulil mugulate arvu ja suurust, päevalillel