Molekulaardiagnostika kordamisküsimused
transkribeeritud RNA
Mikrokiipide tehnoloogiad:
Esineb kaks põhilist mikrokiibi valmistamise tehnoloogiat mis mõnevõrra kattuvad:
1. Oligonukleotiidide süntees in situ kiibil endal: n. Affymetrix® Gene Chips
(oligo- v6i geenifragmendid "ESTd", n.n. cDNA kiibid)
Affymetrix Gene Chip TM:
-Valmistatakse tuhandete lühikeste oligonukletiidide in situ sünteesi teel klaasmaatriksil
-Kiibil vastab 16-20 nukleotiidine ahel ühele kindlale geenile
-Igale oligole kiibil vastab veel teine, mis erineb vaid ühe nukleotiidasenduse poolest
-Võrreldakse proovi intensiivsust kahe partneroligo vahel
-Mõõdetakse geeniekspressiooni absoluutset taset
2. Otsene DNA deposeerimine (spottimine):
Spotitud cDNA mikrokiibid:
Plussid
-Madalam hind ja suurem paindlikus
-Kahe erineva bioloogilise proovi paralleelne võrdlus (n. vähirakud ja normaalne kude,
mõjutatud rakud ja normaalsed rakud)
-EST-de kasutamine võimaldab uute geenide avastamist
Miinused