Molekulaardiagnostika
· kvalifikatsioon ekspressiooni profileerimine
· Eri patogeenide tuvastamine (tollis)
Loetakse fluorestsentsanduritega.
Affymetrix Gene ChipTM: Klaasil kovalentse linkeri abil fotoaktiivsed järjestused, mask ees.
Vahel avatakse teatud positsioonid maskis ja lisatakse mingi nukleotiid, mis ühineb ->
protekteeritakse -> mask ette tagasi -> avatakse järgmised positsioonid. Nii sünnibki jupphaaval
oligonukleotiid. Oligokiibid:
Uuritakse absoluutset geeniekspressiooni taset
kui palju saab sekveneerida (?)
SNPde genotüpiseerimine
Spotitud cDNA mikrokiibid: DNA kloonid klaasile, kuhu hübridiseeritakse RNA, millest
tehtud cDNA, mis värvitakse ja hübridiseeritakse microarrayga. Kahe laseriga (punane,
roheline) mõõdetakse tulemit. Arvuti arvutab välja ekspressioonitasemete pildi: midagi on
tõusnud, midagi langenud, midagi samaks jäänud. Näiteks anname rakukle kuumasoki ja siis