"oksoaniooni" - 1 õppematerjal

Molekulaarbioloogia

- DNA-sse ei tohi sattuda ribonukleotiid. RNA-sse võib mõni desoksüribonukleotiid sattuda. - dNTP (desokspnukleosiidtrifosfaat) – palju erinevaid konformatsioone. rNTP – jäigem konformatsioon, tugev mõju naabernukleotiidile. DNA-sse ei tohi sattuda. - kahevalentsed metallid regleerivad Pi-rühma hapnikuga (Mg2+), kui seondub, siis hapnik kaotab laengu ja stabiliseerib. - kui aluspaar on moodustunud, siis sulgub ensüümi aktiivtsenter. - aktiveeritakse 3’O, tekib oksoaniooni (O-), see on Mg2+-ga koordinatiivse sidemega seotud (st ei reageeri omavahel). β ja gamma Pi tunnevad ära Lys ja Arg (elektrostaatiline interaktsioon). - türosiin aitab lämmastikalust õiges kohas hoida. Tyr sulgeb ensüümi aktiivtsentri. Pi on uue nukleotiidi α-Pi, see reageerib eelmise nukleotiidi oksoaniooniga: R-O- + Pi-R. Lahkuv rühm on PPi, see ei lahku kohe, vaid siis, kui toimub ensüümi translokatsioon st