"nukleotiidipositsiooniti" - 1 õppematerjal

Molekulaarne evolutsioon

ja järjestuste aluspaarilist koostist, töötaksid korrektselt? Milliseid kõrvalekaldeid eeldustest võib esineda? Tooge näiteid mudelitest, mis neid kõrvalekaldeid arvesse püüavad võtta! Eeldused: 1. Mudelist tulenevad asenduse kiirused kehtivad kõigile nukleotiidipositsioonidele. Kõrvalekalded: keskmised asenduse kiirused imetajate geenides ja pseudogeenides on erinevad. Asenduse kiiruse varieerumist nukleotiidipositsiooniti võtavad arvesse GTR + I, GTR + Γ, GTR + I + Γ. 2. Nukleotiidi asendus ühes nukleotiidipositsioonis ei mõjuta nukleotiidi asendust teistes nukleotiidipositsioonides. Kõrvalekalded: kompensatoorsed asendused rRNA geenides (C  G asendus). 3. Asenduse kiirus on konstantne ajas ja liinides. Kõrvalekalded: asenduste kiiruse muutumine ajas on iseloomulik valkude evolutsioonile