Molekulaarne evolutsioon
antud sõlme ja selle eellase ühisosa.
36. Millised on säästumeetodi eksimused? Mis on vigade
põhjuseks?
Pika haru probleem – homoplaasiad eksitavad säästumeetodit. Võib
esineda juhul, kui evolutsiooni kiirus varieerub liiniti. Kui vale puu on
säästlikum kui tegelik puu, siis säästumeetod eelistab valet puud,
kuna seal on vähem asendusi.
37. Selgitage tõepära meetodite põhimõtet.
Alustuseks arvutatakse tõepära ühele nukleotiidipositsioonile.
Arvutatakse tõenäosus näha tippudes teatud nukleotiide. Mõni neist
võimalustest võib olla vähem täenäoline kui teised, kuid mitte ühegi
variandi tõenäosus ei võrdu nulliga. Tõenäosused liidetakse kokku ja
saadakse tõepära. Eeldades, et nukleotiidipositsioonid
evolutsioneeruvad sõltumatult, korrutatakse kõigi
nukleotiidipositsioonide tõepärad ning saadakse kogu puu tõepära
väärtus