"nukleotiidipositsioonidele" - 1 õppematerjal

Molekulaarne evolutsioon

järjestuste aluspaarilist koostist. 24. Millised eeltingimused peavad olema täidetud, et DNA evolutsiooni mudelid, mis diferentseerivad asenduste kiirusi ja järjestuste aluspaarilist koostist, töötaksid korrektselt? Milliseid kõrvalekaldeid eeldustest võib esineda? Tooge näiteid mudelitest, mis neid kõrvalekaldeid arvesse püüavad võtta! Eeldused: 1. Mudelist tulenevad asenduse kiirused kehtivad kõigile nukleotiidipositsioonidele. Kõrvalekalded: keskmised asenduse kiirused imetajate geenides ja pseudogeenides on erinevad. Asenduse kiiruse varieerumist nukleotiidipositsiooniti võtavad arvesse GTR + I, GTR + Γ, GTR + I + Γ. 2. Nukleotiidi asendus ühes nukleotiidipositsioonis ei mõjuta nukleotiidi asendust teistes nukleotiidipositsioonides. Kõrvalekalded: kompensatoorsed asendused rRNA geenides (C  G asendus). 3