"nukleotiidipositsioonid" - 1 õppematerjal

Molekulaarne evolutsioon

seotud seisundite jada. Nukleotiidipositsioonil on neli seisundit: A, C, G, T. markovi mudel määratleb ühest seisundist teise ülemineku tõenäosuse ehk annab nukleotiidi asenduse tõenäosuse. 22. Milles on sarnased ja mille poolest erinevad Jukes- Cantori üheparameetriline ja Kimura kaheparameetriline mudel? Nii JK kui Kimura mudeli kohaselt toimuvad asendused juhuslikult kõigi nelja nukleotiiditüübi vahel, nukleotiidipositsioonid on  samaväärsed ning nukleotiidid on samaväärsed. Samuti on sarnasuseks see, et mõlemas mudelis kõigi nelja nukleotiiditüübi sagedused järjestustes on võrdsed. JK üheparameetrilise mudeli puhul on kõigi asenduste kiirused võrdsed, kuid Kimura kaheparameetrilise mudeli kohaselt on transitsioonidel ja transversioonidel erinevad kiirused. 23. Iseloomustage Hasegawa, Kishino ja Yano mudelit ning üldist pööratavat mudelit.