Molekulaardiagnostika kordamisküsimused
-Andmepanga valik: kus ja kuidas säilitada andmeid?
Andmete eeltöötlus ja normaliseerimine:
-Filtreerimine: müra (taustsignaal) kõrvaldamine? Madala intensiivsusega signaalid
(spots)? Küllastunud signaalid? Madala kvaliteediga signaalid (ghosts spots, tolmu spots
etc).
-Ekstreemsed proovid?
-Koduhoidjad (housekeeping) geenid = kontrollgeenid
-Intensiivsusest sõltuv (tavalisene): globaalset intensiivsust või globaalset suhet kasutades
arvutatakse üks normaliseerimifaktor
Mikrokiipidel põhinevad valk-DNA seostumiskohtade uuringud:
-Kaardistamine kasutades kromatiini immunopretsipitatsioonitehnikaid ja kiipe.
-----Valgud ristseotakse (crosslinking) genoomsele DNA-le in vivo.
-----DNA lõigatakse ensüümidega või mehhaniliselt
-----DNA-valk kompleksid immunopretsipiteeritakse
-----Eri allikatest pärit (kotroll ja test DNA) kompleksidega seostatakse linkerid ja
amplifitseeritakse ning märgistatakse erinevate värvidega
-----Tulem hübridiseeritakse kiipidele
annaabi.ee 
