Imputeerimine
Märkimisväärsed SNPi
alleelisageduste erinevused viitavad võimalikele uutele geenidele ja
lookustele. Seejärel viiakse läbi replikatsioonitest, et teha kindlaks
tulemuse õigsus.
56. Vähigeneetika: onkogeenid, proto-onkogeenid, tuumor
supressorgeenid, LoH ja Knudsoni hüpotees, genoomi
stabiilsus.
Onkogeen on geen mis on muutnud konformatsiooni, nt DNA
kahjustuse tõttu, ning muutunud pahaloomuse kasvaja tekitajaks.
Protoonkogeen on nomaalne geen, mis muutub aktiivseks
onkogeeniks mutatsiooni tõttu. Osalevad tavaliselt rakutsükli
kontrollis, aitavad reguleerida proliferatsiooni, diferentseerumist ja
apoptoosi. Onkogeeni tekkimisel on see kõik häirunud – suureneb
proliferatsioon, apoptoosi ei toimu.
Tuumorsupressorgeen on nt p53. Tuumorsupressorgeenid osalevad
rakkude ebanormaalse proliferatsiooni ja geneetilise ebastabiilsuse
vältimisel.
LOH – loss of heterosygosity – normaalne alleel on lookuses