Ramsari konventsioon
aastal 30 sookatseala (Kuresoo,
1998).
Märgalade kaitse korraldamine on olnud juba pikemat aega looduskaitse tähelepanu
keskmes. Heas seisundis märgalade võrgustik on eluliselt tähtis näiteks veelindudele
kogu nende rändetee ulatuses. Samuti on märgalade hea seisund oluline ka
kahepaiksete, kalade, veetaimede ning paljude selgrootute populatsioonidele. Paraku
konkureerivad kaitse alla võetud märgalad veeressursside pärast sageli
niisutusprojektide, asundustele või tööstusettevõtetele vajalike veereservuaaride,
üleujutuste kontrollsüsteemide ja hüdroelektrijaamde veehoidlatega. Üheks võimalikuks
märgalade kaitse strateegiaks on võtta kaitse alla terviklik valgala. Matsalu rahvuspargis
merre suubuva Kasari jõe valgala on liiga suur, et seda täies ulatuses kaitsta, kuid Kasari
vee kvaliteedi parandamiseks on koostatud kaitsekorralduskava ja algatatud mitmeid
suurprojekte (Primack jt., 2008).