Molekulaar- ja rakubioloogia
antikehad tunnevad ära ühe valgu mitut piirkonda ehk epitoopi. Epitoop võib olla
konformatiivne kui ka liniaarne. Konformatiivne epitoop on selline epitoop, mida antikeha
tunneb 3D struktuuri, ehk natiivsel kujul. Mõned kemikaalid või termiline töötlus võivad seda
struktuuri muuta. Liniaarne epitoop on primaarne peptiidjärjestus. Monoklonaalsed antikehad
üldjuhul spetsiifilisemad, aga polüklonaalsed antikehad annavad tugevama signaali kuna
neidseondub märklaud valgule rohkem. Lisaks eristatakse antikehi selle järgi, kas nad on
peptiidijärjestuse spetsiifilised või tunnevad valgu ära konformatsiooni ja domääni, sellest
sõltub millise meetodi jaoks antikeha sobib.
Rakkudes immuunofluorestsentsi vaatamiseks inkubeeritakse rakupreparaate fluorestseeruva
märgisega (FITC, Alexa, Cy, jne.) konjugeeritud antikehadega. Enamasti tehakse kahekihiline
annaabi.ee 
