Loomade areng evolutsioonis
piisavalt mitmekesiselt, et hõivata endale silmapaistvat ökoloogilist positsiooni
13
Paleogeeni meredes. Oma teise õitsengu saavutasid riffe ehitavad korallid, kes olid
loovutanud oma domineeriva rolli Kriidi ajastu keskel rudistidele. Paleotseenis oli
korallriffe veel vähe, mis viitab sellele, et nad ei taastunud kiiresti. Eotseeni soojas
kliimas levisid korallid taas laiaulatuslikult. Suur osa lubi nannoplanktonist kadus
Kriidi ajastu lõpus, mitmekesistus aga uuesti Paleogeenis. Ränivetikad (diatomeed)
ja dinoflagelaadid levisid ookeanides kogu Kainosoikumi jooksul, just nagu ka Kriidi
ajastulgi.
Mitmed eluvormid Paleogeeni meres sarnanesid eellastele Hilis-Kriidist, kuid oli ka
täiesti uusi vorme. Kõige erilisemad selle perioodi mere elusorganismidest olid
vaalad, kes arenesid Eotseeni jooksul lihasöövatest maismaaimetajatest ja muutusid
suurteks merekiskjateks