Mikroobifusioloogia
üheahelalise katke ning võimaldavad katkestatud ahelal keerelda ümber katketa
ahela. Sellega muudavad nad DNA linking number'it 1 võrra. Sellest klassist on
kõige olulisem topoisomeraas Topo I (TopA), mille ekspressioon E. coli's
võimendub statsionaarses faasis, siis kui bakterite kasvukiirus hakkab vähenema.
Topo I vähendab DNA negatiivset superspiralisatsiooni.
Topoisomeraasid klassist II teevad DNAsse kaheahelalisi katkeid ning
muudavada DNA linking number'it 2 võrra ning on ATP-st sõltuvad. Klassi
topoisomeraas II kuulub güraas, mis on E. coli's üks olulisemaid DNA negatiivse
superspiralisatsiooni tekitajaid. Güraas tunnetab bakteri füsioloogilist seisundit
ATP/ADP suhte järgi. Kui bakter on toitaineterikkas keskkonnas ning suudab
toitaineid lagundada, siis ATP hulk rakus suureneb ja güraas aktiveerub. Güraas
suurendab DNA negatiivset superspiralisatsiooni ning soodustab replikatsiooni