Mikroobifusioloogia
Näiteks Enterobacter sp 638 on leitud palju
transponeerivaid DNA-elemente, mis piirnesid kolonisatsiooniks vajalike
geenidega, lisaks on sellel tüvel palju konjugatiivseid plasmiide, mis aitavad
koloniseerimisele kaasa. Genoomi suurusel ja taimede koloniseerimisvõimel on
leitud üldine seos. Suuremate genoomidega bakterid on võimelised koloniseerima
mitmeid taimi, samas kui väiksema genoomiga bakterid on rohkem
spetsialiseerinud ühele või mõnele taimeliigile.
Mutualistlikel bakteritel on genoomist võimalik leida palju biosünteesi eest
vastutavaid geene, samas kui patogeenidel võib leida palju degradatsiooniks
vajalikke ja virulentsusgeene. Patogeenidel on vaja degradeerida taimeraku
seina, samas kui mutualistlikud bakterid pigem aktiveerivad stressivastuse
geene, mis aitavad taime tekitatud stressist jagu saada. Kui patogeenidel on
levinud palju sekretsiooniga seotud geene, siis mutualistlikel bakteritel on leitud