Evolutsioon
Rekonstrueeritakse ka
eellasseisundid.
Distantsmeetod lähtub eeldusest, et need kelle viimane ühine eellane elas hiljem, on
sarnasemad kui need kelle oma elas varem. Otsib puud, mille korral kokkulangevus
vaadeldavate distantside ja puu distantside vahel oleks suurim.
7. Mida tähendavad i) paralleelne muteerumine, ii) mutatsiooniline küllastumine? Tee
joonised. Kuidas need mõjutavad distantsmeetoditega fülogeneesi rekonstrueerimist?
i) paralleelne muteermine positsioonilised homoloogilised nukleotiidid võivad olla identsed
konversiooni tõttu.
ii) mutatsiooniline küllastumine ühes ja samas nukleotiidipositsioonis on toimunud mitu
asendust. Aja jooksul selline küllastumine kasvab. Mida kauem aega tagasi toimus
lahknemine, seda enam erineb vaadeldud erinevuste arv - vaadeldud erinevuste arv hindab
alla tegelikku evolutsioonilist muutust. Mida varem on taksonid lahknenud ja mida kiiremini