Valkude ruumiline struktuur
Valkude kokkupakkumist uuritakse jälgides eelstatsionaarse faasi kineetikat.
Nõuab reaktsiooni jälgimist esimese mõne millisekundi jooksul.
Levinthali golfiväljaku kujuline Lehtrikujuline energiapind
energiapind
Valkude kokkupakkumine on kooperatiivne protsess
1. Lokaalsete sekundaarstruktuuride formeerumine 5 ms
2. Tertsiaarstruktuuri moodustumine algab, subdomeenide teke ,
hüdrofoobne kollaps 1s
3. Domeenide lõplik moodustumine, H sidemed 5s
4. Multidomeense struktuuri moodustumine
Kokkupakkumine võib olla pidurdatud metastabiilsete
vaheühendite tekke kaudu. Kokkupakkumist assisteerivad
ensüümid:
1. Peptidüülprolüül isomeraas
2. Disulfiidi isomeraas
3. Saperonid (E.coli GroELGroES)
Hemoglobiin ja müoglobiin
Hemoglobiin hapniku transportimine veres. Punaste vereliblede valk
Müoglobiin lihasrakkude valk
Mõlemad valgud sisaldavad prosteetilise rühmana heemi
Müoglobiin monomeerne valk, 1 heem