Maximum likelihood ehk suurima tõepära meetodi kasutamine fülogeneesipuude tegemisel
Kuid tänu sellele
on ML ka ülimalt aeglane, mis on antud meetodi suurimaks miinuseks. Lisaks ei pruugi alati
õiged olla aluspaaride sageduste muutustesse puutuvad eeldused. Kolmandaks ei saa selle
meetodiga arvesse võtta morfoloogilisi tunnuseid, kuna nende muutumiste tõenäosusi ei saa
me kuidagi leida.
Kasutatud materjalid:
Bioinformatics and molecular evolution. By Paul G. Higgs and Teresa K. Attwood.
Blackwell: Oxford, UK. ISBN: 1405106832
http://www.life.umd.edu/labs/delwiche/MSyst/lec/Likelihood-1.html (25.03.07)
http://www.icp.ucl.ac.be/~opperd/private/phenetics.html (25.03.07)
annaabi.ee 
