Toiduainetes spoore moodustavad mikroobid
tuhanded atmosfäärid, eriti kui kombineerida kõrgete temperatuuridega. Looduses on tõenäolisem,
et spoori germinatsiooni kutsuvad esile kindlad toitained (Setlow, 2014).
Pärast toitelise stiimuli saamist toimub viiteperiood (lag period), mis võib populatsiooni
individuaalsetel spooridel kesta mõnest minutist kuni 24 tunnini (Setlow, 2014).
Oletatakse, et enamik muutusi toimub sisemembraani läbilaskmisvõimes ja võimalik, et ka
struktuuris, toimub monovalentsete katioonide H+, K+, Na+ ja seejärel CaDPA vabanemine.
Enamiku CaDPA vabanemine toimub mõne minuti jooksul ja kõige tõenäolisemalt läbi spoor-
spetsiifiliste SpoVa proteiinide moodustatud kanalite. Need proteiinid on kodeeritud ühe või
enama operoni poolt kõikidel spoore moodustavatel batsillidel ja klostriididel. CaDPA
vabanemine lõpetab germinatsiooni I faasi ning kutsub esile II alguse. Koore-lüütilised ensüümid
lagundavad peptidoglükaankoore