Terminid
4. Arutelu
· Antud uuringus identifitseerisime 35 SNARE geeni nisu genoomist
kasutades homoloogia otsinguid.
· Eeldatakse, et nisu, millel on suur genoom (16.94 Gb), võib sisaldada palju
rohkem SNARE geene.
· Me tuvastasime kolm SNARE homoloogi geeni (SNARE3, SNARE5 ja SNARE6)
nisu kultivarist HD2329+Lr28 kasutades homoloogia otsinguid.
· Fülogeenetiline puu näitab et SNARE3 ja SNARE5 kuuluvad Qc II gruppi ja SNARE6
kuulub Qb II gruppi.
· Modelleri tarkvara abiga , prognoositi kõigile kolmele SNARE geenile 3-D struktuurid.
· Kõigis kolmes mudelis avastati -heliksilised aktiinfiiberi struktuurid.
· SNARE6 poolt kodeeritud polüpeptiiidide mudelis näib olevat kaks väikse pöördega
eraldatud -heliksilise rulli lõiku, ja kaks rulli murduvad üksteise peale as a hairpin.
· See on analoogiline SNAREdele nimega SNAP (SNAP-25, SNAP-29, SNAP-47) mida
tuntakse kui Qbc SNAREsid, kuna nad sisaldavad kahte SNARE domeeni (Qb & Qc)