BIOKEEMIA harjutustunni küsimuste vastused II KT-ks
seejärel hävitamiseks. Leeliseses keskkonnas võib nukleofiil ehk antud juhul OH- tõmmata ära
2' OH-rühmalt H+, nõnda tekib 2'-O-, mis atakeerib (nö. ründab) +P fosfodiestersidemes.
DNA, RNA üldiseloomustus
2. Millised on DNA molekulide võimalikud sekundaarstruktuuri vormid? Milles on nende
erinevused? Milline on natiivse DNA sekundaarstruktuuri põhivorm?
DNA sekundaarstruktuur on tavaliselt jaotatud biheeliksiks, biheeliksi ahelad kulgevad
mitteparalleelselt, komplementaarsete aluspaaride vahel on vesiniksidemed. Suhkur-fosfaat
põhiskelett väljaspool; lämmastikalused seespool. Paremakäeline kaksikheeliks jätab
aluspaaride omavaheliseks kauguseks 3,4 Å.
Lineaarsel biheeliksil on kolm vormi:
A-vorm: paremakäeline, lühike ja lai 2,3 Å, 11 bp pöörde kohta.
B-vorm: paremakäeline, pikem ja peenem 3,32 Å, 10 bp pöörde kohta.
Z-vorm: vasakukäeline, pikim ja peenim 3,8 Å, 12 bp pöörde kohta.
3