Koostu tegemine algusest peale: mida iga bioloog peaks teadma
suuruseks on 1,89 Mb. Shotgun genoomi projekt hõlmab endas mitut järku: DNA murdmine
juhuslikest punktidest, saadud järjestuste sekveneerimine ja assambleerimisprogrammidega esialgse
molekuli taastamine kasutades selleks eelnevalt sekveneeritud fragmentide liitmist. Skäffoldimist
peetakse vajalikuks etapiks kogu genoomi shotgun projekti jaoks, kuna võimaldab kõrgkvaliteedilise
mustandgenoomi järjestuse loomist, millelelt edasiselt on võimalik andmete edasine analüüs ja
tulemuste tõlgendamine.
Joonis 1. Genoomi koostu paneb genoomi kokku lühikestest DNA sekventsijuppidest.
Koostu kvaliteet
Kuigi esineb teravaid probleeme koostute tegemisel, ei takista see asjaolu uute genoomiprojektide
alustamist. Projekt i5k alustati aastal 2009 ja selle eesmärgiks on 5000 putukagenoomi
sekveneerimine. Sellele järgneb Genome 10K projekt, mille eesmärk on sekveneerida 10 000
selgroogse genoomi