Molekulaardiagnostika kordamisküsimused
-Trinukleotiid-(GCC)(GCC)(GCC)
-Tetranukleotiid-(AATG)(AATG)(AATG)
-Pentanukleotiid-(AGAAA)(AGAAA)
-Heksanukleotiid-(AGTACA)(AGTACA)
Alleelide kindlakstegemiseks vajalik suurusel põhinev DNA lahutamine;
dinukleotiidsete korduse korral vaja paremat resolutsiooni.
4.Mikrovariantsed STR alleelid (definitsioon, tähistamine) ja null-alleelid (esinemine,
miks probleemsed).
STR markerite bioloogilised "artefaktid":
-"Stutter" produktid
-Matriitsist sõltumatu nukleotiidi lisamine
-Mikrovariandid
-Null-alleelid
-Mutatsioonid
Mikrovariantsed alleelid ja redelivälised alleelid :
-Mitte kõigil alleelidel ei ole täispikka kordusühikut
-Osaliste kordusühikutega alleele tähistatakse: täiskorduste arv - punkt - aluste arv
osalises korduses
-Näide: TH01 9.3 alleel(AATG)6(-ATG)(AATG)3
Mikrovariandid:
-Defineeritakse alleelidena, millel pole aluskordusmotiivi täpseid kordusi või esinevad
kordusmotiivi järjestuse variandid või mõlemad