Mikroobifusioloogia
fluorescens, P. putida kui ka taimpatogeene nagu P. aeruginosa, P. syringae, kui
ka inimpatogeene P. aeruginosa. Sarnaselt perekonnale Pseudomonas võib leida
ka teistest bakteriperekondadest nii mutualistlikke baktereid, kommensante kui
ka patogeenseid liike.
Klassist -Proteobacteria on enim kirjeldatud perekonna Rhizobium ja
Bradyrhizobium, mis on tuntud N2-fikseerijatena liblikõieliste juurtes. Lisaks veel
perekondi Methylobacterium ja Sphinomonas. Methylobacterium on võimeline
kasutama metaani kui ainukest süsiniku- ja energiaallikat ning arvatakse, et selle
pärast on perekond Methylobacterium risosfääris domineeriv.
G(+) bakterite hulgas on kõige enam kirjeldatud hõimkonda Actinobacteria
(20%), millest tuntuim on Streptomyces antibiootikumide tootmisvõime poolest.
Firimicutes'te klass Bacilli (15%) on samuti endofüütide hulgas väga sagedasti
kirjeldatud. Bacillus thuringiensis on tuntud kui kristalliliste valkude tootja, mis on
annaabi.ee 
