"meetrikut" - 1 õppematerjal

Koostu tegemine algusest peale: mida iga bioloog peaks teadma

suuda kunagi peegeldada tegelikku olukorda piisavalt rahuldaval tasemel. Assemblathon 2 projektis pidi töötlema ka tõelisi sekveneerimisandmeid, mis pärinesid näiteks papagoilt ja boamaolt. Järeldused Assemblathon, GAGE ja dnGASP jõudsid kõik ühele järeldusele ­ ka kõige paremad koostud sisaldavad olulisi ja rohkelt vigu. Iga bioloog peaks silmas pidama, et täiuslikku genoomi ei saa nendega koostada. Samuti järeldus, et ideaalset ainuõiget meetrikut ei eksisteeri. Stateegiad, mis teevad vähem vigu, teevad seda pikkuse arvelt. See halvendab edasise analüüsi kvaliteeti, sest informatsiooni on vähe. Võimalik oleks tulevikus jooksutada programme varasemalt hästikirjeldatud genoomide (hiir ja inimene) põhjal. Samuti peab silmas pidama, et programm tuleb valida vastavalt andmete spetsiifikale: see, mis sobib hästi prokarüootsete genoomide puhul, ei pruugi sarnaseid tulemusi eukarüoodsete organismide korral saavutada.