Maastiku meetrikud Patch richness e. eraldiste mitmekesisus PR iseloomustab maastikku Oleneb mõõtkavast Suure praktilise väärtusega Näitab erinevate maakattetüüpide arvu Mida rohkem erinevaid maakattetüüpe, seda mitmekesisem maastik Piirangud On tundlik maakatteklassifikatsioonisüsteemi suhtes Annab infot maakattetüüpide arvukuse kohta Ei ütle kui suurt maa-ala maakattetüüp hõlmab Class Area Proportion (CAP) Väljendab maakattetüüpide osakaalu Harvaesinevate maakattetüüpide avastamine Väljendatakse suhtarvu või protsendina Kasulik loodusvarade majandamisel, maakasutuse muutmisel, maastiku planeerimisel jne. Piirangud Ei näita, kuidas maakattetüübid jagunevad Jääb selgusetuks, milline on maakattetüüpide liigendatus ja kuju Usaldusväärsus sõltub sellest, kui täpselt maakattekaart koostatud on
vigadeprofiiliga kui sekveneerimise teerajajaks osutunud Sangeri meetodi lugemid (read). Seega peavad tarkvarade loojad pidevalt olema arengutega kursis ja kohastuma nii, et loodavad programmid suudaksid andmeid õigesti töödelda. Kuna sisendandmed on kiires muutumises, on keeruliseks osutunud ka seniste koostute kvaliteedi hindamine. Kui genoom saab assembleeritud ehk taas kokkupandud, mille alusel võivad teadlased väita, et tegemist ongi absoluutselt õige koostuga? Meetrikud, mille alusel antakse koostutele kvaliteedihinnanguid ei ole sugugi mitte alati üksteist võimendavad. Esineb lõivsuhe õigsuse (vigade puudumise) ja pikkuse parameetrite vahel. Järgmiseks oluliseks hetkeks on otsuse langetamine, kumb iseloomustaja on olulisem, kas pikkus või vigade puudumine? Koostu tegemine algusest peale ehk de novo assembly Koostuid on võimalik üles ehitada kahel erineval viisil. Vastavalt sellele, kas on olemas referents-