Molekulaarne evolutsioon
(median-joining network)?
Arvutatakse kauguste maatriks. Konstrueeritakse minimaalkauguste
võrk (MSN) – tehakse minimaalkauguste puu, mis ühendab kõik
antud järjestused nii, et ei tuletata lisasõlmi, ei teki tsükleid ja puu
kogupikkus on minimaalne. Kõik minimaalkauguste puud, mis antud
andmestiku põhjal saab konstrueerida, ühendab minimaalkauguste
võrku (MSN). Farrise algoritm lisab minimaalkauguste puu
kogupikkuse vähendamiseks puuduvaid mediaanvektoreid. Lõplik
ühendatud mediaanide võrk on valimis sisalduvate ja hüpoteetiliste
haplotüüpide minimaalkauguste võrk.
52. Mis on mediaanvektor? Mediaanvektori konstrueerimine
haplotüüpide kolmikule binaarsete ja ≥2 tunnuse seisundiga
tunnuste korral. (Näited!)
Mediaanvektor konstrueeritakse
kõigile sellistele järjestuste
kolmikutele, milles üks järjestus on
ühendatud kahe ülejäänuga ning
mediaanvektori lisamisel puu