Faagiteraapia
mille tõttu lagundatakse bakterisse sattunud faagi DNA, siis võivad faagis vastukaaluks tekkida
mutatsioonid DNA-s, mille tõttu ei ole enam bakterite endonukleaasid võimelised degradeerima
faagi DNA-d (Carlton, 1999).
Uute faagisüsteemide arendamine on palju odavam kui uute antibiootikumide välja töötamine
ning erinevalt antibiootikumidest, ei mõjuta faagid ning nende produktid eukarüootseid rakke.
Seega kõrvalmõjusid esineb faagiteraapias vähem kui antibiootikumidega ravimisel (Matsuzaki,
2005).
Bakteriofaagide genoomide modifitseerimine
Bakteriofaagide antimikroobsete omaduste võimendamiseks on välja töötatud erinevaid
tehnikaid. Hiljuti loodi uus in vivo tehnika: bakteriofaagi elektroporeeritud DNA
rekombineerimine ehk BRED (bacteriophage recombineering of electroporated DNA). BRED
töötati välja Mycobacterium’i faagide jaoks, kuid seda saab rakendada ka teiste faagide peal.
BRED-i puhul viiakse elektroporatsiooni abil faagi DNA bakteriraku sisse ning plasmiidis
annaabi.ee 
