“Valgu biosüntees 2012” loengute põhipunktid
Kindla väärtusega m/z ioonide kvantitatiivne suhe näitab
peptiidide ja seega ka valkude suhet. Trüpsiin lõikab valguahelat positiivselt laetud
3
AH (R, K) C-terminaalselt. LysC lõikab vaid lüsiini tagant. Kümotrüpsiin lõikab
aromaatsete AH (F, Y, W) tagant. Kasutades massi märkega ühte neist AH-st, saab
kindla massnihkega peptiide.pSILAC. Pulss märkimisega SILAC. Rakkudele lisatakse
erineva märkega aminohappeid (söötmevahetus). Jälgitakse kahe või enama märkega
peptiidide suhet LQC/MS abil. Võimaldab analüüsida paljude valkude sünteesi
kineetikat samades rakkudes. Näide: hiire fibroplastide kultuur – globaalne
geeniekspressiooni regulatsioon. mRNA ja valkude eluead ning koopiaarvud.
Aminoatsüül-tRNA süntetaasid
annaabi.ee 
