"mamaviirus" - 1 õppematerjal

Putukate, vetikate ja ainuraksete suured DNA genoomsed viirused

NCLDV-d on ürgset päritolu viiruste grupp; analüüsid näitavad, et nende eellased pärinevad ajast, millal toimus prokarüootide ja eukarüootide lahknemine (ca 2 miljardit aastat tagasi). Amööbi viirus – mimiviirus Mimiviiruse peremeheks on amööb Acanthamoeba polyphaga; viiruse molekulaar-bioloogiast on veel teada väga vähe, tõenäoliselt replitseerub ta nii raku tuumas kui ka tsütoplasmas. Teada on mitu viiruse varianti (üks tüvedest kannab nime mamaviirus) Genoom • Genoomiks on lineaarne dsDNA, mille otste läheduses asuvad 900 bp pikkused inverteeritud korduvjärjestused. Seega on võimalik, et nakatatud rakkudes võib mimiviiruse DNA omandada ka tsirkulaarse kuju. • Genoomi mõõtmed on viiruse kohta erakordselt suured: 1,181,404 bp (võrdluseks: bakteri Mycoplasma genitalium genoom on 580 kbp pikkune). • Kodeeriv ala moodustab genoomist üle 90%, lugemisraamid paiknevad mõlemas DNA