7 Jaan Kaplinski on abielus 1969. aastast Tiia Toometiga, kes on kirjanik ja oli 1994-2007 Tartu Mänguasjamuuseumi direktor. Esimesest abielust Küllike Kaplinskiga on tal tütar Maarja Kaplinski (s. 1964). Jaanil ja Tiial on pojad Ott-Siim Toomet (s. 1970), Lauris Kaplinski (s. 1971) ja Lemmit Kaplinski (s. 1980) ja tütar Elo-Mall Toomet (s. 1981). Ott-Siim on füüsika ja majandusteaduse magister ning kaitses 2006 majandusdoktori kraadi Aarhusi ülikoolis Taanis. Ta töötab vaheldumisi Aarhusi ja Tartu Ülikoolis. Lauris lõpetas ülikooli biokeemikuna, praegu töötab ta peamiselt infotehnoloogia alal, on olnud kaua Linux- opsüsteemi arendaja, nüüd tegeleb Tartu Ülikooli Raku- ja molekulaarbioloogia instituudis bioinformaatikaga. Lemmit õppis ülikoolis filoloogiat ja semiootikat, semiootikuna ta ülikooli ka lõpetas. Peale selle tegeleb ta kompuutritega, sealhulgas samuti Linuxiga, luuletamisega ja
kutsuti Moskvasse, temast sai Nõukogude Edgar Tõnurist. Neist Greeni ja Tõnuristi võib Liidu Teaduste Akadeemia Majandusinstituudi Nõukogude aja oludes pidada suhteliselt vanemteadur (195159, 196769) ja eestimeelseteks võimukandjateks, kes siinset sektorijuhataja (195967). 1964. aastal kaitses ta kultuuri, haridust ning põllumajandust või majandusdoktori kraadi, kaks aastat hiljem sai maluste piires edendada püüdsid. Nad suutsid temast professor. Karotamm suri Moskvas oskuslike suhtlejatena vastu seista mitmetele 1969. aastal. üleliidulistele kampaaniatele ning mahendada 1950. aastatel Käbini võimupositsioon Moskva survet. Samas ei tuleks neist ka tolle kindlustus