Bioinformaatika ülesanded II - Fülogeneetilised puud.
organismidele:
1. Escherichia coli K12 MG1655
2. Escherichia coli O157 EDL933
3. Salmonella typhimurium LT2
4. Shigella flexneri 301
5. Salmonella enterica serovar Paratyphi A
b. Sooritada antud järjestuste MSA kasutades mõnda programmi (näiteks
ClustalW, EBI).
c. Moodustada nende järjestuste jaoks fülogeneetilised puud kasutades erinevatel
arvutusmeetoditel (kaugusmeetodid, MP, ML) baseeruvaid fülogeneetiliste
puude koostamise programme PHYLIP paketis
(http://evolution.genetics.washington.edu/phylip.html, tutvuda programmide
dokumentatsiooniga, kasutusjuhend
http://koti.mbnet.fi/tuimala/oppaat/phylip2.pdf) salvestatud MSA fail peab
annaabi.ee 
